期刊简介

               本刊创刊于1973年,是一本由卫生部主管的高级医学学术刊物,以报道肿瘤临床和基础理论方面的研究成果及新动态、新进展为主。读者对象为肿瘤防治研究工作者及相关专业的各级医务人员。                

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  • 杂志名称:肿瘤防治研究杂志
  • 主管单位:中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:湖北省卫生厅;中国抗癌协会;湖北省肿瘤医院
  • 国际刊号:1000-8578
  • 国内刊号:42-1241/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中国学术期刊综合评价数据库来源期刊期刊收录:农业与生物科学研究中心文摘, 万方收录(中), 上海图书馆馆藏, 哥白尼索引(波兰), CA 化学文摘(美), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 剑桥科学文摘, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊)
肿瘤防治研究杂志2017年第04期

整合组学数据分析乳腺癌细胞与外周免疫系统的交互作用

魏娜;王丹;何浪

关键词:乳腺癌, 外周血, 生物信息学, 分子对话
摘要:目的 探讨乳腺癌上皮细胞与外周血之间的交互作用.方法 从GEO数据库中获取乳腺癌上皮细胞及外周血单个核细胞(PBMCs)表达谱.GEO2R在线分析工具筛选差异表达基因,利用UniProt和STRING数据库对差异表达基因蛋白产物进行亚细胞定位,筛选乳腺癌细胞分泌蛋白及与其相互作用的PBMCs膜蛋白.Cytoscape软件构建互作网络.使用DAVID在线工具基因功能注释和KEGG通路富集方法对互作分子进行分析.结果 共筛选到101对相互作用分子,基因功能主要涉及细胞黏附、细胞迁移、白细胞激活、免疫反应等生物学过程,参与的信号通路主要有细胞外基质-受体相互作用,细胞因子-细胞因子受体相互作用,趋化因子信号通路等.其中FN1、ITGBI、FLT1、COMP、CXCL 12为关键蛋白.结论 利用生物信息学方法,整合组学数据,能够有效获取信息,为乳腺癌的治疗及预后监测的研究开辟新思路.