期刊简介

               本刊创刊于1973年,是一本由卫生部主管的高级医学学术刊物,以报道肿瘤临床和基础理论方面的研究成果及新动态、新进展为主。读者对象为肿瘤防治研究工作者及相关专业的各级医务人员。                

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  • 杂志名称:肿瘤防治研究杂志
  • 主管单位:中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:湖北省卫生厅;中国抗癌协会;湖北省肿瘤医院
  • 国际刊号:1000-8578
  • 国内刊号:42-1241/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中国学术期刊综合评价数据库来源期刊期刊收录:农业与生物科学研究中心文摘, 万方收录(中), 上海图书馆馆藏, 哥白尼索引(波兰), CA 化学文摘(美), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 剑桥科学文摘, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊)
肿瘤防治研究杂志2015年第05期

生物信息学方法筛选结肠癌相关长链非编码RNA

张新丽;赵艳华;李淑娜;张文玲

关键词:长链非编码RNA, 结肠癌, 基因芯片
摘要:目的 筛选结肠癌中差异表达长链非编码RNA(lncRNA)并探讨其表达情况.方法 从NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台Gene Expression Omnibus(GEO)下载结肠癌基因芯片数据GSE41328,包含10对结肠癌组织及正常组织,用微阵列显著性分析(SAM)软件输出差异表达基因,信息学网站对基因重注释得到lncRNA名称,然后用Gene Cluster和TreeView软件分析差异表达lncRNA数据,进一步验证其表达情况.结果 分析GSE41328发现,与正常组织相比,结肠癌共有66个lncRNA差异表达,其中22个高表达,44个低表达,结肠癌与正常组织表达值倍数均大于2或小于0.5,差异有统计学意义.结论 运用生物信息学方法筛选结肠癌相关lncRNA,可为寻找新的肿瘤标志物提供新的途径,但其结果需要进一步实验验证.