期刊简介
本刊创刊于1973年，是一本由卫生部主管的高级医学学术刊物，以报道肿瘤临床和基础理论方面的研究成果及新动态、新进展为主。读者对象为肿瘤防治研究工作者及相关专业的各级医务人员。
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首页>肿瘤防治研究杂志
- 杂志名称：肿瘤防治研究杂志
- 主管单位：中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会
- 主办单位：湖北省卫生厅;中国抗癌协会;湖北省肿瘤医院
- 国际刊号：1000-8578
- 国内刊号：42-1241/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中国学术期刊综合评价数据库来源期刊期刊收录：农业与生物科学研究中心文摘, 万方收录(中), 上海图书馆馆藏, 哥白尼索引(波兰), CA 化学文摘(美), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 剑桥科学文摘, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊)
基底样型和Luminal A型乳腺癌microRNAs表达谱的生物信息学分析
姜茂竹；麦仲伦；曾融；吴钢；郑燕芳；张积仁
关键词：乳腺癌, 基底样型, luminal A型, 微小RNAs, 生物信息学
摘要：目的 对基底型和Luminal A型乳腺癌microRNAs表达谱进行分析,找出两种分子亚型乳腺癌之间差异表达的microRNAs,并对差异表达microRNAs在不同分子亚型乳腺癌中可能发挥的生物学功能进行初步探讨.方法 从公共基因芯片数据库GEO中筛选基底样型和Luminal A型乳腺癌microRNAs表达谱数据,利用BRB-arrayTools软件筛选出差异表达的microRNAs.对差异表达的microRNAs,利用TargetScan和miRDB靶基因预测软件及TarBase数据库获得可能的靶基因集.利用DAVID数据库,对差异表达micorRNAs的靶基因集进行进一步Gene Ontology和信号通路分析.结果 通过对基底样型和Luminal A型乳腺癌microRNAs表达谱分析获得54个差异表达的microRNAs(P≤0.001).相对于Luminal A亚型乳腺癌,31个microRNAs在基底样型乳腺癌中上调表达,而23个microRNAs下调表达.上调和下调表达microRNAs可能的靶基因集数目分别为4 916和3 217个.对于上调和下调microRNAs的靶基因集,Gene Ontology分析表明,两个靶基因集分别在不同的生物学过程显著富集；KEGG通路分析分别涉及了35条和39条(P≤0.05)；BIOCARTA通路分析则分别涉及5条和9条(P≤0.05).结论 本研究获得了基底样型和Luminal A型乳腺癌差异表达的microRNAs,并通过靶基因功能分析获得差异表达microRNAs在两种分子亚型乳腺癌之间可能参与的不同生物学过程及信号通路,可能在不同分子亚型乳腺癌中发挥不同的调节作用.
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